גרעיני החמנייה עשירים בחומצות שומן רב בלתי רוויים, הם גם מכילים פיטוסטרולים: כולסטרול מן הצומח שמסייע בהפחתת הכולסטרול שמיוצר על ידי הגוף.
גם גרעיני החמנייה מכילים כמות יפה של חומצות אמינו שחיוניות להתפתחות תאים ורקמות הגוף. הם מומלצים בין השאר לנשים הרות ומניקות ותורמים ליצירת חלב.